Mira, no entiendo muy bien que es el archivo "VIDEO_TS.md5" ese archivo probablemente no deba ir en el disco, probá antes de grabarlo, abrirlo con algun reproductor de dvd como el PowerDVD y fijate si funciona correctamente el DVD. Sino probá quitando ese archivo.
Despues para grabar con Nero es simple, seleccionas DVD Video y todo este contenido lo arrastras dentro de la carpeta Video_TS (roja) y luego lo grabar.